DOSプロンプトで
dir /s /b
とする。
リダイレクトすれば、ファイルに書き出せる
あとはルートフォルダをテキストエディタで一括置換すればOK
http://www.atmarkit.co.jp/ait/articles/0412/04/news014.html
ファイルの属性（作成日や更新日）もとれるが
dirのコマンドは組み合わせると他のコマンドが無効になることもあるので
フリーソフトのFilistryも使える
http://www.forest.impress.co.jp/library/software/filistry/
Windowsでサブフォルダを含めたファイル一覧の出力方法
MS-DOS